La Facultad Ciencias de la Salud fue creada mediante Resolución del Honorable Consejo Universitario N° 26/2002; anteriormente, la Carrera de Medicina fue creada mediante Resolución del Honorable Consejo Universitario N° 71/1998, e inicia sus actividades académicas en marzo del año 1999.
Actualmente, la Facultad ofrece cinco Carreras a nivel Licenciatura: Carrera de Medicina, Enfermería (sedes Oruro, Challapata y Huanuni), Odontología, Atención Temprana y Educación Infantil, Nutrición y Dietética (sede Toledo), y un Programa a nivel de Técnico Medio en Enfermería (sede Huachacalla).